@Morpehry y @JustABard son geniales. Si, hay desincronizaciones puntuales. Después de entregar el proyecto descrubrimos esto, que no se si es a lo que te refieres. Lo dejo por si le sirve a alguien :)
https://docs.godotengine.org/en/stable/tutorials/audio/sync_with_audio.html
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En Godot nunca he hecho un juego de ritmo, pero tiene pinta de que ahí lo explican bien. En Unity es esto: https://docs.unity3d.com/6000.0/Documentation/ScriptReference/AudioSettings-dspTime.html.