hola y disculpa el idioma use este motor y tengo algo que puede ayudarte con tu problema.
pixel game maker mv es bastante amable en esa parte
abre el juego
preciona F1
te saldra una barra verde con 2 opciones
presiona settings
y baja a la cuarta opcion
controller settings ( es la cuarta opción )
aquí puedes modificar tus botones ya sea teclado o incluso añadirle un mando. (controlador)
una corrección la cuarta opción si ayuda a detectar mandos
la que estas buscando es la segunda
operation settings (con esta puedes remapear los controles ya sea teclado o mando)